BioM arbeitet mit zahlreichen nationalen und internationen Life Science Organisationen und Netzwerken zusammen, um Informationen und Erfahrungen (Best Practices) auzutauschen, Kooperationen zu initiieren und Synergieeffekte zu schaffen.
- BIO Deutschland - Vereinigung der deutschen Biotechnologie-Regionen
- Council of European BioRegions (CEBR): Gründungsmitglied und Beirat. In der Special Interest Group (SIG) Incubation dient München als Modellregion für international umsetzbare Konzepte bei Gründerzentren. Außerdem engagiert sich BioM aktiv in den SIGs Shared Facilities und Cluster Managers.
- 2009 war München als Partnerregion mit dem Antrag "ABCEurope" (Advanced Biotech Cluster Platforms for Europe) im Rahmen des "Europe INNOVA CIP-EIP Work Programme 2009" erfolgreich.
- Von September 2006 bis Dezember 2008 war BioM im "EurOffice Services"-Programm aktiv, einem europaweiten Netzwerk von 21 branchenübergreifenden Inkubatoren, das von der „Pro INNO“-Initiative der Europäischen Kommission gefördert wurde.
- Deutsch-Russischer Kooperationsverbund Biotechnologie 2011-2013. Das primäre Ziel des Deutsch-Russischen Kooperationsverbundes ist es, die Zusammenarbeit sowohl zwischen Unternehmen und Kliniken wie auch wissenschaftlichen Einrichtungen in Russland und Deutschland zu initiieren. Im Mittelpunkt der Zusammenarbeit stehen dabei Biotechnologien, Biophotonik und Medizintechnik, sowie die direkte klinische Forschung.
- Kompetenznetze Deutschland - Bündelung der innovativsten und leistungsstärksten nationalen Kompetenznetze mit technologischer Ausrichtung durch das Bundesministeriums für Wirtschaft und Technologie (BMWi)





